Открыты белки, кодирующие потенциал человеческого цитомегаловируса
Новое открытие удивительно сложного белка, кодирующего потенциал человеческого цитомегаловируса, или HCMV, обеспечивает первые шаги к пониманию того, как вирус манипулирует клетками человека во время инфекции. Геном HCMV впервые был пронумерован более 20 лет назад, но ученые уже исследовали протеом — полный набор выраженных белков, из этого общего патогена. HCMV является невероятно распространённым вирусом, им заражены большинство людей на планете. Врожденные дефекты и болезни, однако, наблюдаются у новорожденных и взрослых с ослабленной иммунной системой. Возбудитель также имеет один из крупнейших известных вирусных геномов, с массивом в 240000 пар оснований ДНК. (Для сравнения: геном полиовируса содержит только около 7500 пар оснований).
«Ноам Штерн-Гиноссар из Университета Калифорнии в Сан-Франциско вместе с коллегами из США и Германии использовали комбинацию методов, в том числе рибосомы профилирования и масс-спектрометрии для изучения протеома HCMV. Этот метод может быть использован для исследования белков, продуцируемых также другими вирусами», — говорят ученые-исследователи. Их выводы опубликованы в журнале Science, который издается некоммерческим научным обществом АААС (Американская ассоциация содействия развитию науки).
«Геном вируса является только отправной точкой», — пояснил Джонатан Вайсман из Университета Калифорнии, соавтор научного доклада. «Понимание того, что белки кодируются этим геномом, позволяет нам начать думать, что вирус делает, и как мы можем влиять на него. Каждый из белков, что мы определили, имеет потенциал, показывающий нам, как этот вирус манипулирует своей принимающей клеткой». Ноам Штерн-Гиноссар и другие исследователи подозревают, что существующие карты белков, кодирующих потенциальные HCMV, основанные в значительной степени на вычислительных методах, были не до конца проработаны. Таким образом, они начали отображение позиции рибосом — клеточных органелл, в которых синтезируются белки HCMV инфекции человеческих клеток фибробластов. В результате Штерн-Гиноссар и ее коллеги обнаружили шаблоны для сотен ранее неизвестных белков, которые были закодированы в соответствующих сегментах ДНК вирусного генома, известных как «открытые рамки считывания».
«Удивительно, но исследователи обнаружили, что многие из этих открытых рамок считывания кодируют исключительно короткие белковые последовательности (менее 100 аминокислот). И некоторые из вновь выявленных открытых рамок считывания даже скрываются внутри других рамок», — говорят исследователи. «Основным выводом нашей работы является то, что каждый из этих шаблонов может кодировать более одного белка», — сказала Аннет Михальски из Института Макса Планка по биохимии в Martinsried (Германия), другой соавтор научного доклада. «И эти очень короткие белки могут быть более общими, чем мы ожидали».
Исследователи применили масс-спектрометрию для подтверждения наличия многих неизвестных вирусных белков, которые были выявлены путем сопоставления рибосомы позиции. В будущем, эта связь рибосомы профилирования с масс-спектрометрией могут быть использованы для исследования протеома других сложных вирусов. В конце концов, такая информация может быть использована, чтобы понять, как различные вирусы захватывают клетки своих хозяев.
Источник: medicalnewstoday.com
- Клюква повышает спортивные результаты
- Скрытая опасность усталости после сна
- Томатный сок эффективно убивает сальмонеллу и другие вредные бактерии
- Прорыв в лечении пищевой аллергии
- Роль сельской жизни в укреплении детского иммунитета
- Как осознанность усиливает упражнения
- Генетический код семян Чиа
- Новый метод лечения легочной гипертензии
- Как Глазго-Каролинские часы точно измеряют биологическое старение
- Лечение серповидно-клеточной анемии
