Бактериологические исследования спинномозговой жидкости направлены на выявление возбудителей различных инфекций:
- кокковой группы (менинго-, пневмо-, стафило- и стрептококки) при менингитах и абсцессах мозга;
- бледной трепонемы — при нейросифилисе;
- микобактерии туберкулеза — при туберкулезном менингите;
- токсоплазм — при токсоплазмозе;
- пузырьков цистицерка — при цистицеркозе.
Вирусологические исследования спинномозговой жидкости направлены на установление вирусной этиологии заболевания (некоторые формы энцефалитов, экзогенных психозов).