Лечение злокачественных опухолей полового члена почти всегда комбинированное, сочетают хирургическое вмешательство, лучевую терапию и полихимиотерапию. Операция включает удаление первичного очага в пределах здоровых тканей в сочетании с удалением регионарных паховых и повздошных лимфатических узлов. Комплексное лечение с использованием блеомицина, метотрексата, полихимиотерапии позволяет уменьшить число органоуносящих операций и улучшить результаты лечения. Вирусные кондиломы распознаются без затруднений. Назначение местных аппликаций 5 % мази 5-фторурацила, электрокоагуляция или лазерное удаление опухоли при ранних стадиях являются эффективными.