Возбудитель — вирус гепатита В — относится к нетаксономической группе Hepadnaviridae. Вирионы ("частицы Дейна") округлой формы, диаметром 42-45 нм, покрыты наружной липопротеидной оболочкой. Содержат нуклеокапсид с двунитчатой циркулярной ДНК, одна нить которой короче другой почти на 1/3 и ДНК-зависимую ДНК-полимеразу.
Вирус гепатита В высокоустойчив к низким и высоким температурам, многим дезинфицирующим средствам, длительному воздействию кислой среды. Инактивируется при автоклавировании в течение 30 мин.