Диагноз ставится на основании клинических симптомов, эпидемиологических данных и результатов лабораторных исследований. Для выявления возбудителя производят посев материалов, взятых от больных, на питательные среды. Материалом для исследования служат кровь, рвотные массы, промывные воды желудка, испражнения. Ботулотоксин выявляют в реакции нейтрализации (биологической пробы на мышах).