Форма митохондрий в большинстве случаев округлая или палочковидная, реже — нитевидная. Оболочка митохондрий состоит из двух мембран толщиной чаще всего 7-10 нм. Между ними находится перимитохондриальное пространство, а внутри митохондрии располагается матрикс.
Внутренняя мембрана образует многочисленные выпячивания:
-
в большинстве случаев это листовидные кристы;
-
трубочки (тубулы) — у многих простейших и в некоторых клетках млекопитающих (в клетках, продуцирующих стероидные гормоны);
-
кармановидные мешочки часто встречаются у растений.
Однако они могут быть артефактом, возникшим при фиксации крист.