К руководству относятся начальники МСГО. Ими являются руководители соответствующих органов управления здравоохранением всех уровней.
Органы управления представлены штабами МСГО и управлением больничной базой (УББ).
К силам МСГО относятся медицинские невоенизированные формирования и учреждения.
В основу организации сил и средств МСГО положены следующие принципы.
1. Территориально-производственный принцип (создаются в основном на базе существующих учреждений и органов здравоохранения).
2. Принцип универсализации подготовки (т.е. предназначены для работы в любых очагах массовых поражений).
3. Принцип функционального предназначения (т.е. для каждого формирования и учреждения определяется приоритетное функциональное предназначение).