При стафилококковой этиологии заболевание применяют полусинтетические пенициллины — оксациллин, метициллин (внутримышечно по 10—12 г в сутки). При отсутствии эффекта через 3—5 суток к терапии присоединяют гентамицин (внутримышечно 120 мг в сутки). При непереносимости пенициллинов используют цефалоспорины. При отсутствии эффекта препараты могут быть заменены ванкомицином (внутривенно по 1 г 2—3 раза в сутки) или линкомицином (внутримышечно 1—1,5 г в сутки).
Если возбудителя не удается выделить, лечение обычно проводят пенициллином по 20000000 ЕД/сутки в сочетании с гентамицином или стрептомицином.
После достижения эффекта (нормализация температуры тела, картины крови, уменьшение почечной недостаточности, мочевого синдрома) антибактериальная терапия продолжается не менее 4—6 недель. Аминогликозиды не должны применяться без перерыва более 10 дней.
Если после достижения эффекта антибактериальной терапии сохраняется высокая активность почечного процесса, следует присоединить преднизолон (30—40 мг в сутки). При неэффективности консервативной терапии рекомендуется хирургическое лечение — замена пораженных клапанов сердца протезом.