Атипичная форма острой дизентерии протекает в виде острого гастроэнтерита или гастроэнтероколита. Эта форма характеризуется лихорадкой (до 38–39°С), симптомами общей интоксикации, болями в подложечной области, тошнотой, повторной рвотой, в дальнейшем появляется жидкий стул, иногда с примесью слизи и крови.
Отмечают тахикардию и понижение артериального давления. Язык обложен, отмечаются болезненность в подложечной и пупочной областях, урчание и плеск в животе.
Субклинические формы характеризуются отсутствием симптомов интоксикации и выраженных кишечных расстройств.