Вирусный гепатит G вызывается возбудителем из семейства флавивирусов. Геном его представлен одноцепочечной РНК линейной формы. Поскольку вирус гепатита G не вызывает стойкого иммунного ответа, ни один традиционный серологический тест не пригоден для диагностики данного заболевания; единственный способ специфического диагноза — выявление РНК вируса (HGV RNA) с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР).