Заболевание может быть обусловлено рядом факторов. Некоторые исследователи склоняются к мнению, что болезнь Крона — это псевдотуберкулезный иерсиниоз. Возникновение очагов гранулематозного воспаления с последующим изъязвлением обширных участков стенки кишечника приводит к истощающей диарее, кишечному кровотечению, анемии, интоксикации, диспротеинемии, нарушению электролитного баланса и, в конечном итоге, к септическим осложнениям.