Применяют амфотерицин В, обычно в сочетании с другими противогрибковыми препаратами (5-фторцитозин, кетоконазол, миконазол, изоконазол и др.). Амфотерицин В вводят внутривенно, под оболочку спинного мозга (при менингоэнцефалите), лечение длительное до 6 недель (при менингоэнцефалите), курсовая доза 1-2,5 г.
Прогноз при иммунодефицитных состояниях (ВИЧ-инфекции) неблагоприятный.